Le navire océanographique Alexandria s'approche de Point Nemo, dans le Pacifique Sud. C'est là, à 2688 km de la terre la plus proche, qu'Arthur, sorti de prison, poursuit ses recherches scientifiques. Lui et son équipe, dont fait partie sa fille Rachel, viennent de faire une découverte majeure.

Chargé des tests ADN, Zack découvre l'identité du tueur. Mais il disparait avant d'avoir pu révéler le nom de l'assassin, et les séquences ADN ont été détruites. La tension monte d'un cran à bord du bâtiment, et l'enquête se poursuit. Rachel se retrouve bientôt enfermée dans la chambre froide, tandis qu'Arthur échange avec Maggie sur les réseaux et découvre sa véritable identité.

Les tests ADN ont confondu Charlie. Assassin présumé de Kowalski et probablement de Zack, l'homme d'équipage est enfermé dans une cabine, au grand désespoir de son frère Oscar, bien déterminé à le libérer. Ce dernier sollicite l'aide d'Amy et promet en échange de ne rien dire de son appel passé au Qatar.

Arthur a compris que quelqu'un cherche à lui voler ses recherches. Après s'être échappé, Charlie avait coupé l'électricité, mettant en danger autant l'Alexandria que les précieuses algues. Pour redémarrer le moteur, Alec et monsieur Wan descendent aux machines où se cache Charlie. Maggie touche au but : elle a localisé la maison de Rachel et a soutiré des informations à son colocataire.

Gloria, membre de l'équipe scientifique, est retrouvée morte avec le badge de Kowalski dans sa poche. Arthur, qui git blessé à ses côtés, affirme qu'elle a voulu le tuer. Amy se confie à Yuto et cherche à le convaincre de voler un échantillon d'algues. Pendant ce temps, Maggie, acculée, est sommée d'enregistrer des aveux de culpabilité pour les meurtres commis sur Polaris VI.

Le cargo menace d'exploser. Il reste peu d'issues aux survivants qui n'ont pas d'autre choix que d'embarquer dans l'unique canot de sauvetage et de s'échapper ensemble, en attendant l'arrivée d'un bateau japonais qui a capté leur message de détresse. Mais le tueur est encore parmi eux. Alors qui est-il ? Bientôt le carnet de notes de Kowalski apporte des réponses, d'ultimes révélations sur toute cette histoire.